Cambio interno

Hola! Esto es netamente laboral y por favor necesito consejos!!!

En la empresa para la cual trabajo me ofrecieron un nuevo cargo, lo que conlleva cambiar de filial, y para ello me finiquitarán pero sin hacer pago de haberes debido a que es considerado un “traspaso” misma empresa, pero diferente filial (diferentes rut) mi duda es: esto se puede? Ya me cambiaron el rut y al sacar certificados de antigüedad laboral no se me reconocen los años de mi antigua filial.

Llevaba 3 años, los perdería???? Y lo otro, también acorde a contrato tengo un bono anual, este también lo perdería?? Considerando que trabaje 8 meses del año... agradezco sus consejos!!!