Boletas atrasadas

Prestó servicios a varias empresas y una de ellas me pidió que anulará una boleta y la volviera a emitir porque puse mal la fecha.
Siempre se demoran mucho en pagar... Son muy desordenados y pésimos pagadores :S

El tema es que me pagaron la boleta que anule y ahora están intentando pagarme la nueva boleta... Qué hago?
Sí recibo el dinero después me lo pueden quitar cierto? O puedo tener problemas frente al SII?